华侨城湿地与深圳湾水系相通，生物资源共有，是深圳湾滨海湿地生态系统的重要组成部分，属滨海湿地。华侨城湿地不仅是深圳湾湿地的重要延伸，还与香港米埔自然保护区隔海相望，是我国唯一处在现代化大都市腹地的滨海红树林湿地。

华侨城湿地有“城市之肾”的美誉，它是国际候鸟重要的中转站、栖息地。每年有数万只候鸟南迁北徙在此停留。宽阔的水面、茂盛的芦苇、稀疏的草甸、葱郁的红树林吸引了100多种、数千只鸟在此栖息，包括黑脸琵鹭等10种国家保护鸟，7种中国濒危鸟，8种广东省重点保护鸟类。